KCHL bepalingenwijzer

DPD deficiëntie genotypering

Naam / omschijving
DPD deficiëntie genotypering
Zie
Monstermateriaal
bloed
Afnamemateriaal
EDTA-buis 6 ml paarse dop
Hoeveelheid
1 buis
Afname informatie

Naam, geboortedatum en patiëntnummer op buis vermelden.
LET OP: een barcodesticker zonder patiëntgegevens wordt niet geaccepteerd.
Datum en afnametijd vermelden op aanvraagformulier en paraaf van degene die het afgenomen heeft. 

Ook mogelijk om DPD deficiëntie fenotypering aan te vragen.

Test:
Varianten DPYD*2A = IVS14+1G>A (rs3918290), c.2846A>T (rs67376798), c.1236G>A (rs56038477) en c.1679T>G = DPYD*13 (rs55886062) .

Techniek:
Real-time PCR (Taqman)

Uitkomst van de test:
Uitslag wordt becommentarieerd. 

Achtergrond:
Dihydropyrimidine dehydrogenase (DPYD) is betrokken bij het metabolisme van de cytostatica: 5-Fluoruracil (5-FU), capecitabine en tegafur. Een verlaagde DPYD enzymactiviteit (DPD deficiëntie) geeft een verhoogd risico op ernstige bijwerkingen van het cytostatisch geneesmiddel.

Dihydropyrimidine dehydrogenase deficiëntie kan worden aangetoond middels fenotypering (meten van enzym activiteit in leukocyten) en middels genotypering (mutatie analyse in het DPYD-gen). De mutaties DPYD*2A = IVS14+1G>A en c.1679T>G = DPYD*13 veroorzaken een inactief allel. De mutaties c.2846A>T en c.1236G>A veroorzaken een verminderd actief allel.

De activiteitscore is een optelsom van actieve (waarde 1), inactieve (waarde 0) en verminderd actieve allelen (waarde 0.5)

Etnische variatie in prevalentie fenotypes en allelfrequentie 

 

prevalente fenotype (%)

genvariantfrequentie (%)

ras

land

PM#

IM#

NM#

*2A

2846
A>T

1236
G>A

*13

Kaukasisch

 

0,1-0,2

3-5

95-97

0-1,4

1

0,3-3,7

0,1

 

Nederland

 

 

 

0,6

0,7

2,5-3,7

 

Aziatisch

ZW-Azië

 

 

 

0-0,75

 

 

 

 

Oost-Azië

 

 

 

0-2,7

0

 

 

Afrikaans-
Amerikaans

 

 

8

 

0

 

 

 
















 



# Onder de begrippen PM (poor metabolizer), IM (intermediate metabolizer) en NM (normal metabolizer) wordt in bovenstaande tabel het volgende verstaan:
PM: 0 volledig functioneel allelen (genactiviteitsscore 0 of fenotypering)
IM:  1 volledig functioneel allel (genactiviteitsscore 1 of 1,5)
NM: 2 volledig functioneel allelen (genactiviteitsscore 2) 

KNMP Farmacogenetica-Dihydropyrimidinedehydrogenase (DPD)

Referentiewaarden
Volwassenen

Opmerking
Kinderen
Opmerking
Doorbelgrenzen
Uitvoerende instelling
KCHL ETZ-E Moleculaire biologie
Contactpersoon
Vakanalist, Klinisch Chemicus Specialist Laboratoriumgeneeskunde
Volume
1 ml volbloed
LIMS-code
DPYD
Monstervoorbewerking
Bewaren bij 4ºC, NIET centrifugeren
Houdbaarheid
Bewaren bij 4ºC; geïsoleerd DNA is gedurende lange tijd houdbaar bij 4-8°C of bij -20°C.
Nabepalen binnen
Cito-afhandeling
Voor cito-afdeling
Voor gewone afdeling
Opmerking
Frequentie
2 x per week
Transportcondities binnen de regio
kamertemperatuur
Transportcondities buiten de regio
kamertemperatuur
NB
Literatuur
Verzending
Declaratiecode
070007
NZA-tariefcode